COT I humane DNA wird exklusiv aus humaner Plazenta-DNA durch Scheren, Denaturieren und Reannealing hergestellt. Die Konditionen sind dabei so gewählt, dass repetitive Sequenzen angereichert werden, sodass die COT I Fraktion der humanen DNA weitgehend aus schnell annealenden repetitiven Elementen besteht.
COT I humane DNA kann zur Unterdrückung der Kreuzhybridisierung von humaner repetitiver DNA in Filter- und Microarray-Hybridisierungen und In-situ-Hybridisierungen verwendet werden.
Repetitive Elemente können bei einer Sonde in unspezifischen Hybridisierungssignalen resultieren. Um eine spezifische Hybridisierung an den chromosomalen Zielort zu gewährleisten, wird die Sonde zusammen mit einem Überschuss an unmarkierter COT I humaner DNA als Kompetitor denaturiert. Dadurch wird die Einzelkopie-Genhybridisierung nicht durch repetitive Sequenzen gehindert.

Applikationen